Nedavno objavljena studija „Soil eDNA-based droplet digital PCR assay as a new monitoring tool for terrestrial mammals“ u časopisu Global Ecology and Conservation, koju je provela istraživačka skupina s Instituta za biološka istraživanja „Siniša Stanković“ u Beogradu pod vodstvom prof. Vanje Bugarski-Stanojević, a uz ključan doprinos prvog autora Marka Đokića, pokazuje iznimnu učinkovitost QX200 droplet digital PCR sustava tvrtke Bio-Rad Laboratories u identifikaciji kralježnjaka iz okolišne DNA (eDNA) dobivene iz tla.
Glavne značajke studije:
• Validacija ddPCR kao alat za identifikaciju kralježnjaka iz eDNA izolirane iz tla
• Optimizicija protokol za detekciju pet kriptičnih podvrsta sljepaša, podzemnog glodavca, putem detekcije gena citokrom b
• Pridonosi razvoju strategija očuvanja usmjerenih na teško uočljive ili ugrožene vrste
• Mogućnost prilagodbe za širu primjenu na druge kopnene kralježnjake od značaja
Doprinos Labene ovom projektu uključivao je:
• Razvoj vrsno-specifičnih početnica i proba za ddPCR testiranja
• Organizacija dvodnevne praktične radionice o ddPCR laboratorijskim tehnikama
• Doprinos znanstvenom radu kroz koautorstvo Lucije Markulin iz Labene
Ova suradnja pokazuje kako precizni molekularni alati poput ddPCR tehnologije mijenjaju područje zaštite prirode omogućujući bržu, osjetljiviju i neinvazivnu detekciju vrsta.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2351989425003816